Sekcja dyscyplinarna zajmuje się przestępstwami zastrzeżonymi dla Dykasterii i rozpatrywanymi przez nią w ramach jurysdykcji ustanowionego tam Najwyższego Trybunału Apostolskiego. Jej zadaniem jest przygotowywanie i przeprowadzanie procedur przewidzianych przez normy kanoniczne, tak aby Dykasteria w swych odpowiednich organach (prefekt, sekretarz, promotor sprawiedliwości, kongres, sesja zwyczajna, kolegium do rozpatrywania rekursów w sprawach delicta graviora) mogła zapewnić prawidłowe wymierzanie sprawiedliwości.
W tym celu sekcja inicjuje odpowiednie inicjatywy szkoleniowe oferowane przez Dykasterię ordynariuszom oraz prawnikom, aby upowszechniać poprawne rozumienie i stosowanie norm kanonicznych, odnoszących się do jej obszaru kompetencji.